オオシマザクラの完全ゲノム配列を解明―サクラ品種の花色や開花時期、形態の遺伝子解明に道：国立遺伝学研究所/森林総合研究所
(2025年2月4日発表)
国立遺伝学研究所と（国）森林総合研究所による研究チームは２月４日、サクラの染井吉野（そめいよしの）の親にあたるオオシマザクラの全染色体構造を解明したと発表した。オオシマザクラはこれまで日本のサクラ品種の多様化に大きな役割を果たしてきただけに、この成果がサクラの遺伝や進化、発生、育種などに大きく役立つと期待される。
日本で最も親しまれているサクラ「染井吉野」はオオシマザクラとエドヒガンの雑種であることが知られている。遺伝研の竹中要博士が約60年前に解明した。今回の成果はそれをさらに深めるもの。
遺伝研の藤原 一道 特任研究員、豊田 敦 特任教授、森林総研の勝木 俊雄 博士らが「サクラ100ゲノムコンソーシアム」を結成。
伊豆大島にある樹齢800年の国の天然記念物「大島のサクラ株（さくらっかぶ）」から、許可を得てDNAを抽出し、高度なゲノム解析技術で全染色体の構造解読にかかった。
通常の長鎖、短鎖のDNA配列を読み取り、細胞内でDNAがどのように立体的に配置されているかを調べた。ゲノムアセンブリと呼ばれる手法を使って、DNA断片配列をコンピューターで組み立て、完全なゲノム配列を再構成した。
作成した「オオシマザクラ」ゲノムを「カンヒザクラ」や「モモ」のゲノムと比較したところ、構造と配列でカンヒザクラとオオシマザクラとは96％、モモとは92％の高い類似性を持つことを確認した。
